CM – 4 faits sur la variante brésilienne du SRAS-CoV-2

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Depuis son apparition fin 2019, le virus SARS-CoV-2 a évolué naturellement en raison des mutations induites lors de sa réplication. Il existe actuellement trois variantes principales de ce virus: la variante britannique, la variante sud-africaine et la variante brésilienne, toutes trois de lignées différentes. La variante brésilienne, en particulier, est beaucoup plus contagieuse que la variété originale et suscite désormais de nombreuses inquiétudes dans le monde entier.

Les vols entre la France et le Brésil sont désormais suspendus jusqu’à nouvel ordre. Comme dans plusieurs pays, les autorités sanitaires françaises s’inquiètent: le Brésil est actuellement dans une vague particulièrement meurtrière (4000 décès en 24 heures mardi) qui touche de plus en plus de jeunes (plus de la moitié des patients en réanimation ont moins de 40 ans). ans)).

Par séquençage du génome d’échantillons collectés entre novembre 2020 et janvier 2021 à Manaus dans le nord-ouest du Brésil, les épidémiologistes ont déterminé l’émergence et la propagation d’une nouvelle variante discutable du SRAS-CoV-2, la lignée P. 1, identifié. Cela diffère de la forme virale d’origine en ayant 17 mutations, dont trois sont dans la protéine de pointe (ou pointe) du virus. Cependant, ce trio impressionnant (K417T, E484K et N501Y) est lié à une liaison accrue des particules virales au récepteur ACE2 dans les cellules humaines. En d’autres termes, ces mutations permettent au virus d’infecter plus facilement les cellules hôtes.

Nombre d’admissions et de décès quotidiens à Manaus entre mars 2020 et mars 2021. En décembre 2020, les admissions ont augmenté de façon exponentielle. Crédits: N.R. Faria et al., MedRxiv, 2021.

Les analyses ont montré que la lignée P.1 est apparue dans la région de Manaus début novembre 2020 et a précédé une période d’évolution moléculaire très rapide. Les experts estiment que cette forme virale peut être 1,4 à 2,2 fois plus transmissible que la forme originale. De plus, il est de 25 à 61% plus susceptible d’échapper à l’immunité induite par une infection antérieure causée par une forme virale d’une autre lignée. Enfin, des données préliminaires suggèrent que cette variante brésilienne est 1,1 à 1,8 fois plus susceptible de causer la mort.

Cependant, l’Organisation mondiale de la santé a besoin de plus d’études et de données de séquençage du génome pour déterminer la portabilité et la gravité de cette variante. une incidence et un taux de mortalité particulièrement élevés dus au COVID-19 (13,6 millions de cas et plus de 360 ​​000 décès à ce jour). L’OMS souligne cependant que la variante a provoqué «l’effondrement des systèmes de santé à Manaus» et qu’il est donc difficile de déterminer si cette mortalité élevée est due uniquement à la variante ou à l’effondrement des systèmes de santé ou même aux deux. . </ En outre, les décisions du président brésilien Jair Bolsonaro, qui refuse de lancer un endiguement national malgré la dévastation actuelle, ont probablement joué un rôle dans cette épidémie.

La variante brésilienne, également appelée VOC 3 (pour Variante de Concept3, les deux premières étant les variantes britannique et sud-africaine), est présente dans 32 pays, dont la France. Il a été découvert pour la première fois en février 2021, mais est toujours minoritaire aujourd’hui. Le dernier bulletin de situation publié par Santé publique France le 8 avril indique que la proportion de variants brésiliens ou sud-africains suspectés est estimée à 4,2% et reste stable pour le moment.

Jusqu’à présent, le COV 3 ne représente que 0,5% des nouveaux cas de contamination, tandis que la variante britannique (COV 1) est répandue en France et touche désormais plus de 80% des cas. Selon les experts, leur présence empêcherait la variante brésilienne de se coloniser les uns après les autres: « Ces virus se font concurrence d’une certaine manière », explique le professeur Bruno Lina, virologue et membre du Conseil scientifique.

Oui. Contrairement à la souche virale 2020, cette variante P.1 semble conférer une faible immunité au patient. Comme mentionné ci-dessus, les résultats préliminaires pour cette variante suggèrent un potentiel de réinfection compris entre 25 et 61%. Jusqu’à présent, des études internationales ont montré que seulement 0,3 à 1% des patients seront réinfectés entre six et neuf mois après une infection initiale.

Cette résistance à l’immunité est due aux mutations qui se produisent au niveau de la des protéines phares ont été observées, à savoir N501Y et E484K – également portées par les variants britannique et sud-africain – et K417T (assez proche de la mutation K417N portée par la variante sud-africaine). . Ces trois mutations semblent favoriser à la fois la transmission du virus et la résistance à l’immunité.

Rappelons d’abord que l’immunité générée par la vaccination conduit à deux types de protection: l’une est les anticorps neutralisants, ils sont responsables de la détection et l’élimination des particules virales qui portent le pic de protéine et, d’autre part, pour l’immunité cellulaire, qui mobilise les lymphocytes T cytotoxiques pour éliminer les cellules infectées.

Une étude publiée le mois dernier dans la revue Cell évaluant l’efficacité Cependant, des vaccins Pfizer et Moderna contre des variants ont montré que les variants avec les mutations K417N / T, E484K et N501Y, y compris les anticorps brésiliens et sud-africains, ont échappé à la neutralisation même chez les individus entièrement vaccinés. Et pour cause, ils ciblent le pic de protéine et il a subi des mutations.

En revanche, l’immunité cellulaire pourrait être mieux préservée. Selon les experts, il est donc peu probable que l’infection par cette variante amène une personne vaccinée à développer une forme sévère de la maladie. D’autant que les vaccins développés par Pfizer et Moderna soulèvent des taux d’anticorps très élevés, ce qui pourrait compenser la diminution de l’efficacité de ces derniers. Cependant, la question se pose quant aux vaccins qui ne sont pas aussi efficaces que ces vaccins à ARNm.

Données insuffisantes sur la variante brésilienne pour parvenir à un jugement et des études supplémentaires sont nécessaires pour déterminer l’efficacité de l’évaluation des différents vaccins contre cette souche approuvée En France. Utiliser les canettes Pfizer et Moderna au Brésil dissiperait rapidement le doute. Pfizer a précédemment déclaré que si nécessaire, un nouveau vaccin contre cette variante peut être développé dans les six semaines.

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