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CM – Sars-CoV-2 : ARN, variant, infection, que sait-on ?

Le virus Sars-CoV-2 est un coronavirus apparu en Chine fin 2019 et responsable de la pandémie mondiale de Covid. Nom, composition (ARN ou ARN), protéine de pointe, infection, origine, mutation… Découvrez.

[Mise à jour 24/11/2021 à 12h22] Le virus Sars-CoV-2 est responsable de la pandémie de Covid-19. C’est un virus de la famille des coronavirus qui peut infecter l’homme et provoquer des symptômes plus ou moins sévères. Le Sars-Cov-2, qui est responsable de la pandémie de Covid, est, comme le SRAS et le MERS auparavant, un virus qui peut être mortel pour l’homme. Que sait-on de ce virus ? A quoi ça ressemble ? Combien de temps faut-il pour entrer dans le corps? Est-ce normal qu’il change ? Le point sur l’état actuel des connaissances.

Le virus Sars-CoV-2 est un agent infectieux qui appartient à la grande famille des coronavirus (virus qui sont entourés d’une « couronne » sous le microscope). « Plusieurs coronavirus font partie des virus respiratoires saisonniers les plus courants qui provoquent chaque hiver des symptômes pseudo-grippaux, explique l’Inserm, mais des formes plus sévères qui provoquent des épidémies sont apparues ces dernières années » :

Il existe six types connus de coronavirus chez l’homme : hCoV saisonniers (220E, OC43, NL63, HKU1) et CoV émergents comme Sars-Cov avec une létalité de 10% et MERS-CoV avec une létalité de 35%.

Sras, Mers, Covid-19.. Très contagieux, les coronavirus sont des virus qui se propagent rapidement et présentent un risque élevé de décès pour certaines personnes. Origine, mutation, symptômes, période d’incubation, transmission, résistance aux vaccins… Que sait-on de cette famille de virus responsables d’épidémies contagieuses et mortelles ?

Après le coronavirus initialement « nCoV-2019″ ( » n » pour « Nouveau » et « CoV » pour « Coronavirus »), le coronavirus responsable de la pandémie de Covid-19 a été renommé le 11 février 2020 par. SARS-CoV-2 le Comité international pour la taxonomie des virus (ICTV) :

→ « 2 » car le virus est génétiquement lié au coronavirus responsable de l’épidémie de SRAS (synonyme de SRAS) en 2003.

La protéine Spike (S) est une protéine présente à la surface du virus Sars-Cov-2 qui lui permet de pénétrer dans les cellules de l’organisme. La protéine de pointe interagit avec un récepteur humain appelé « ACE2 » et le virus infecte les humains. Le virus injecte son génome dans la cellule cible infectée et y commence son cycle de réplication. De nouveaux virions se forment et infectent de nouvelles cellules.

Un virus a toujours un génome, qui est de l’ADN ou de l’ARN, de sorte que lors de la classification des virus, une distinction est principalement faite entre les virus à ADN et les virus à ARN. Les virus ont jusqu’à présent été classés en fonction de leur pathogénicité ou de leur taille. Le virus Sars-CoV-2 est un virus à ARN enveloppé de la famille des Coronaviridae du genre Betacoronavirus. ARN ou ARN en anglais signifie « acide ribonucléique » et se produit chez l’homme et dans certains virus.

Le principe de l’ARN messager (messenger ribonucleic acid) est aux yeux du public grâce aux vaccins de Pfizer et Moderna contre le Covid-19 « vulgarisé ». Qu’est-ce que c’est ? Comment ça marche ? Qui est l’inventeur ? Qui a remporté le prix Nobel ? Explications d’Elisabeth Bouvet, Présidente du Comité d’Experts Vaccinations de la Haute Autorité de Santé.

Sars-CoV-2 partage 80% d’identité génétique avec Sars-Cov et 96% d’identité avec le virus de la chauve-souris (RaTG13). L’ARN du SRAS-CoV-2 peut être détecté chez l’homme 1 à 3 jours avant le début des symptômes de Covid-19, avec la charge virale la plus élevée, mesurée par RT-PCR, observée autour du jour de la semaine. suivi d’une diminution progressive dans le temps. Le génome Sars-CoV-2 se compose d’environ 30 000 bases, ce qui en fait le plus long des génomes de virus à ARN connus. A titre de comparaison : le génome de la grippe est long de 10 à 15 000 bases, celui du VIH d’environ 10 000 bases. Les premières séquences du génome du SARS-CoV-2 étaient disponibles fin décembre 2019, toutes en provenance de Wuhan (Chine). Le premier, le 23 décembre.

On ne sait toujours pas exactement d’où vient le Sars-Cov-2. On sait que le réservoir du SARS-CoV-2 est d’origine animale (le MERS a été transmis des chameaux à l’homme et le SRAS des civettes). Pour Sars-Cov-2, la chauve-souris était évidemment le réservoir, mais on ne sait pas comment l’homme a pu être infecté directement. Pour les scientifiques, il s’agirait d’un hôte intermédiaire entre les chauves-souris et les humains. Le pangolin avait été considéré comme cet hôte début 2020, mais la route a depuis été exclue. « Il reste deux hypothèses », explique l’Inserm, qui précise qu' »il n’y a pas de données pointant vers la fuite accidentelle du virus d’un laboratoire »:

Près de deux ans après la survenue du SRAS-Cov-2 est toujours On ne sait pas exactement comment ce nouveau coronavirus, responsable de la maladie de Covid-19, est passé des animaux aux humains. Plusieurs pistes sont à l’étude, dont la possibilité d’un accident de laboratoire « très improbable » selon les experts de l’OMS.

Sars-CoV-2 est le nom du virus qui est responsable de la maladie Covid-19 (CO pour « Corona », VI pour « virus » et « D » pour « maladie » et 19 depuis sa publication en décembre 2019). Les virus et les maladies qu’ils provoquent ont souvent des noms différents. Par exemple, le VIH est le virus qui cause le SIDA et le virus d’Epstein-Barr est responsable de la mononucléose. Comme l’explique l’OMS :

→ Les virus sont nommés d’après leur structure génétique pour faciliter le développement de tests de diagnostic, de vaccins et de médicaments. Les noms des virus sont donnés par le Comité international de taxonomie des virus (ICTV).

→ le nom des maladies est choisi pour faciliter les discussions sur la prévention, la propagation, la transmissibilité, la gravité et le traitement des maladies. Le nom officiel des maladies est donné par l’OMS.

Le virus Sars-Cov-2, apparu fin 2019, a montré dès le début qu’il est très contagieux. Son taux de reproduction initial était de 3, ce qui signifie qu’une personne infectée en infecterait 3 autres sans mesures de protection efficaces. La variante delta du virus d’origine est encore plus contagieuse, avec un taux de reproduction d’environ 6. La personne est contagieuse 2 jours avant l’apparition des symptômes et jusqu’à 7 jours après. L’infectiosité diminue alors.

La maladie Covid-19 est très contagieuse. Alors que le virus historique Sars-CoV-2 a infecté 3 personnes, la variante Delta en a infecté plus de 6. Quelle est la durée de l’infection ? Période d’incubation? Combien de temps êtes-vous contagieux avant et après les symptômes ? Sommes-nous contagieux quand nous sommes asymptomatiques ? Tout savoir.

Le SARS-CoV-2 est un virus très contagieux qui se transmet facilement d’une personne infectée via des gouttelettes ou des aérosols (suspensions de particules plus petites que des gouttelettes) (d’où l’importance de porter un masque de protection et une ventilation régulière des zones fermées) et le contact direct avec une personne ou une surface contaminée (poignée de porte, bureau, etc.). « Son affinité pour les cellules humaines et pour le récepteur cellulaire ACE-2 serait 10 à 20 fois supérieure à celle du SRAS (virus épidémique de 2003), donc une très grande transférabilité, même chez les personnes asymptomatiques », précise l’Inserm.

→ Le SRAS-CoV-2 se transmet par contact direct (serrer la main, câlins), indirectement ou à proximité (moins de 1 mètre) avec une personne infectée par des sécrétions infectées telles que la salive et les sécrétions respiratoires ou par des gouttelettes respiratoires excrétées en cas de une infection. Éternue, parle ou chante.

→ Par voie aérienne : L’agent infectieux se propage sur de longues distances et pendant longtemps par la propagation de gouttelettes flottant dans l’air.

→ Par les surfaces infectées : respiratoire les sécrétions ou les gouttelettes émises par les personnes infectées peuvent contaminer les surfaces et les objets. Les virus SARS-CoV-2 et/ou ARN détectés par RT-PCR peuvent être retrouvés sur ces surfaces pendant des périodes de quelques heures à quelques jours, selon l’environnement et le type de surface. La contamination se produit lorsque l’on se touche la bouche, le nez et les yeux.

Le produit ménager Star L’eau de Javel est un virucide particulièrement efficace pour désinfecter les sols et les surfaces. Mais est-il capable de tuer le coronavirus ? Comment l’utiliser sans risque ? Composition, propriétés, dilution, mode d’action et précautions d’emploi.

→ Encore plus dans le plus petit des espaces : Le Covid-19 Science Council a déclaré en juin 2020 que de très petites particules (<30 µm) peuvent rester dans ces espaces, provoqués par l'évaporation de gouttelettes en parlant et qui contiennent théoriquement un ou plusieurs virions en suspension. L'étude ComCor de l'Institut Pasteur publiée le 17 décembre 2020 montre également que les contaminations dans le ménage de ces adultes sont majoritairement des contaminations du conjoint (64 % des cas). Dans le cas des contaminations hors domicile, il s'agit principalement de contaminations dans l'entourage familial (33 %), puis dans le milieu professionnel (29 %), puis en milieu amical (21 %). « Les repas jouent un rôle central dans cette contamination, que ce soit dans un environnement familier, convivial ou moins professionnel. Les bureaux communs sont également importants sur le lieu de travail. »

Urine, selles, sang, animaux ? L’ARN du SARS-CoV-2 a été détecté dans d’autres échantillons biologiques, dont l’urine et les selles de certains patients, a rapporté l’OMS non publiée en juillet 2020 », conclut-elle. De plus, certaines études ont identifié la présence de SARS-CoV- 2 ARN détectés dans le plasma ou le sérum et indiquaient que le virus pourrait se multiplier dans les cellules sanguines, « cependant, le rôle de la transmission sanguine reste incertain ». ), mais on ne sait pas si ces mammifères infectés présentent un risque important de transmission à l’homme.

Les premières études ont montré que les taux d’anticorps augmentent rapidement dans les 2 à 3 premières semaines après l’infection au Covid puis diminuent progressivement. Après vaccination, les niveaux d’anticorps commenceraient à diminuer après 6 mois.

L’immunité fait référence à la protection contre une maladie infectieuse, soit pendant ch un vaccin ou parce que vous avez déjà été infecté par un microbe, un virus ou une bactérie infectieux. Combien de temps après une infection au Covid ? Après le vaccin Pfizer ? Immunité, naturelle, acquise, innée, durée… Comprendre.

L’immunité croisée permettrait à un patient qui a été touché par un virus plus tôt dans sa vie de se faire vacciner contre un autre virus proche du premier. Qu’est-ce que c’est précisément? Qu’en pensent les scientifiques ?

Tous les virus peuvent muter. « La plupart des virus se caractérisent par une évolution génétique constante, qui, selon le virus, se déroule plus ou moins rapidement. Elle survient surtout après que des mutations aient été introduites dans son génome et est donc un phénomène attendu », confirme Santé Publique France. Après avoir infecté nos cellules, elles se multiplient en faisant des copies d’elles-mêmes. Ce processus n’est pas parfait et les Copies peuvent contenir « erreurs » : les fameuses mutations », rappelle l’Inserm. Ces mutations peuvent par exemple affecter la virulence du virus ou son infectivité. Sars-CoV-2 a muté pour la première fois en juin 2020, a confirmé l’Académie des sciences de France « La mutation peut aller dans les deux sens, dans le sens de plus de virulence ou moins de virulence, plus de contagion, moins de contagion », a expliqué le Dr Gérard Kierzek. En France, le variant alpha venu d’Angleterre s’est imposé jusqu’au début 2021 et a été plus contagieuse que ce virus d’origine, puis la variante delta encore plus contagieuse que l’alpha a pris le relais, pour devenir omniprésente et l’original Les variations du SARS-CoV-2 sont surveillées dans le monde entier et les séquences produites dans chaque pays sont partagées dans des bases de données internationales, dont la base de données GISAID (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data).

Le variant Delta représente la quasi-totalité des virus circulant en France. , soit plus de 99% des virus séquencés. La mutation L452R (portée principalement par le variant Delta) a été détectée dans 96% des échantillons positifs à la mi-octobre. Définition d’un variant, nouveau variant delta, symptômes… Tout ce qu’il faut savoir sur les variants Covid.

Le virus Sars-CoV-2 se trouve dans le mucus d’une personne infectée, donc l’examen de l’échantillon nasopharyngé est inclus la technique RT-PCR (frottis dans la narine) est la référence pour son dépistage. Le test peut aussi être antigénique, il est rapidement et facilement disponible en pharmacie, mais un peu moins précis. Il peut également être détecté dans la salive, mais avec moins de fiabilité. Après tout, ce n’est pas le virus en tant que tel qui est recherché dans le sang (le test est dit « sérologique »), mais les anticorps qui ont pu provoquer son infection.

Avec la reprise de l’épidémie et l’augmentation des cas contacts, l’efficacité du dépistage Covid augmente -Tests par PCR ou antigène. Il en va de même pour les autotests, qui sont à nouveau valables comme passeport sanitaire. Prix, pour les personnes vaccinées, les enfants, en laboratoire, en pharmacie, test positif… Consignes pratiques.

Test rapide pour le Covid, le test d’antigène est désormais payant pour certaines personnes, notamment pour celles qui n’ont pas été vacciné. Combien coûte un test d’antigène ? A la pharmacie ? Dans le laboratoire? Quelle fiabilité ? Combien de temps est-il valable ? Tout savoir.

Dans l’air, dans l’eau, sur la peau, après la mort… Les scientifiques ont rapidement recherché la durée de vie du virus Sars-CoV-2

Le Covid-19 pourrait être par voie aérienne Les autorités sanitaires américaines estiment que plus de 2 mètres sont transmis. Plastique, cuivre, verre, tissu, écran de smartphone… sait-on combien de temps le coronavirus survit à l’extérieur du corps, sur un objet, sur une surface ou sur la peau ? Études et réponses de scientifiques.

Le coronavirus responsable de l’épidémie de Covid-19 pourrait se répliquer et être contagieux jusqu’à 35 heures après un décès. Combien de temps est-il inactif ? Comment attaque-t-il nos cellules ? Combien de temps reste-t-il sur les vêtements du défunt ? Spécialistes de l’éclairage.

Le coronavirus Sars-CoV-2, responsable de la pandémie de Covid-19, se transmet plus fréquemment lors des rassemblements en salle en hiver. Ensuite, le virus peut être inactivé en augmentant la température. Alors le Covid-19 est-il saisonnier ou pas ? Mise à jour des connaissances.

Etude sur les facteurs, comportements et pratiques socio-démographiques en lien avec une infection SARS-CoV-2 (ComCor). Institut Pasteur, 17 décembre 2020.

Transmission du SARS-CoV-2 – Implications pour les précautions de prévention des infections. Document d’information scientifique 9 juillet 2020. OMS.

Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales. Pierre & Faculté de médecine Marie Curie.

Prise en charge de l’alerte épidémique des patients atteints de la maladie COVID-19 Etat des connaissances. Coreb. 14.09.2020.

Résumé

définition
Nom de famille
Protéine de pointe
ARN
origine
Différences Sars-Cov-2 et Covid
infection
transmission
immunité
mutation
Vérifier
Durée de vie

[Mise à jour le 24 novembre 2021 à 12h22] Le virus Sars…

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